Кишечная микробиота может способствовать диагностике назофарингеальной карциномы

Исследовательская группа Центра борьбы с опухолями Университета Чжуншань и Института геномики сельского хозяйства Китайской академии сельскохозяйственных наук в Шэньчжэне впервые в масштабной популяции систематически описала характеристики микробиома кишечника у пациентов с раком носоглотки, выявила значительную связь с уровнем вируса Эпштейна-Барр (EBV) и построила высокоточную модель диагностики и прогнозирования исхода заболевания. Результаты исследования были недавно опубликованы в журнале «Кишечник».

Более 90 % населения мира когда-либо были инфицированы EBV, но лишь у меньшинства развивается рак носоглотки. Ранее роль микробиома кишечника в EBV-ассоциированном раке носоглотки была неясна. Исследовательская группа провела метагеномное секвенирование образцов фекалий 516 пациентов с раком носоглотки и 263 здоровых добровольцев и обнаружила значительное дисбиозное состояние микробиома кишечника у пациентов: наблюдалось снижение количества полезных бактерий, производящих молочную кислоту и участвующих в регуляции иммунитета, и увеличение условно-патогенных бактерий, связанных с воспалением. Ключевым моментом является то, что чем выше уровень EBV ДНК в сыворотке крови, тем сильнее нарушение микробиома кишечника, и эти два показателя тесно коррелируют. Это первый случай, когда в масштабной популяции была выявлена такая взаимосвязь.

Исследовательская группа использовала машинное обучение для отбора 26 ключевых маркеров микробиома для построения диагностической модели. Неинвазивность и удобство тестирования микробиома делают его ценным дополнением к тестированию на EBV, особенно для раннего скрининга и выявления групп высокого риска. Кроме того, группа отобрала 16 видов бактерий, связанных с выживаемостью, и разработала «оценку микробиологического прогноза» (PMS). Анализ секвенирования РНК опухолевой ткани у 36 пациентов показал, что у пациентов с высоким уровнем PMS и EBV ДНК наблюдается значительное снижение доли функционально истощённых Т-клеток в опухолевой микросреде, что указывает на то, что дисбиоз микробиома кишечника может усиливать системную иммунную регуляцию и истощение Т-клеток, индуцированное EBV, тем самым способствуя прогрессированию опухоли. Это исследование является крупнейшим в области изучения микробиома кишечника при раке носоглотки и открывает новые направления для понимания механизмов развития опухолей и их клинического применения.