Разрушительный вирус хлопка скрывался незамеченным на полях США почти 20 лет
Реанализ архивных генетических данных показал, что вирус карликовости хлопчатника присутствовал в США уже в 2006 году, задолго до его официального обнаружения в 2017-м, и распространился по многим штатам, включая Калифорнию
Короткое резюме
Совместное исследование ученых из Службы сельскохозяйственных исследований USDA и Корнеллского университета опровергло представление о том, что вирус карликовости хлопчатника (вирус карликовости листьев хлопчатника, CLRDV) является недавним инвазивным патогеном в США. Анализ архивных образцов и данных общедоступных генетических баз показал, что вирус присутствовал на полях уже в 2006 году в Миссисипи, затем в 2015-м в Луизиане и в 2018-м в Калифорнии. Полевые исследования 2023 года подтвердили первое официальное обнаружение CLRDV в Калифорнии. Это означает, что вирус незаметно распространялся по хлопковому поясу страны почти два десятилетия до того, как был идентифицирован в 2017 году.
Ключевым методом исследования стал повторный анализ (анализ данных) ранее загруженных в открытый доступ генетических последовательностей, что позволило выявить следы вируса в старых образцах. Ученые также обнаружили генетический материал CLRDV в образце из пищеварительного тракта коровы в Калифорнии, что указывает на вероятное потребление животным зараженного растительного корма и косвенно подтверждает широкое распространение вируса в прошлом. Это открытие подчеркивает ценность хорошо поддерживаемых открытых генетических баз данных для ретроспективного отслеживания патогенов.
Исследование возрождает гипотезу о связи CLRDV с давним заболеванием хлопчатника — бронзовым увяданием (бронзовое увядание), что может объяснять некоторые исторические потери урожая. Для фермеров результаты означают, что вирус, вероятно, более распространен, чем считается, и его необходимо учитывать в стратегиях мониторинга и управления. Работа демонстрирует важность междисциплинарного сотрудничества и биоинформатики для выявления скрытых угроз агрокультуре.
Вирус присутствовал в США с 2006 года
Генетический анализ подтвердил наличие CLRDV в образцах хлопка из Миссисипи 2006 года, что на 11 лет раньше официального обнаружения в 2017 году
Широкое географическое распространение до обнаружения
Вирус был выявлен в Луизиане (2015), Калифорнии (2018) и, вероятно, других штатах, что указывает на его длительное скрытое распространение по хлопковому поясу
Первое официальное обнаружение в Калифорнии
Полевые исследования 2023 года подтвердили присутствие CLRDV в Калифорнии, что является первым официальным документированием вируса в этом штате
Следы вируса в неожиданных источниках
Генетический материал CLRDV был найден в образце из пищеварительного тракта коровы, что свидетельствует о потреблении зараженного растительного корма и косвенно — о широкой циркуляции вируса в агроэкосистеме
Текст сгенерирован с использованием ИИ
