Ученые ускоряют исследования «тёмных белков»
В геноме человека тысячи игнорируемых «тёмных белков» получили официальное название «пептидные белки» и были включены в официальные базы данных, что обещает новую волну биомедицинских исследований.
Короткое резюме
Журнал «Природа» недавно опубликовал исследование, которое присвоило официальное название тысячам ранее игнорируемых «скрытых белков» в человеческом геноме — пептидины (peptideins) — и включило их в широко используемые в научном сообществе базы данных генов и белков. Эти молекулы кодируются частями генома, которые ранее считались неспособными продуцировать белки, они очень короткие и не имеют эволюционных гомологов, поэтому долгое время не учитывались в официальной статистике.
«Скрытые белки» исключались из баз данных из-за низкого содержания аминокислот, очень малой длины и отсутствия эволюционных гомологов, но большинство из них кодируются генами, близкими или перекрывающимися с уже известными белковыми кодирующими генами. Альянс TransCODE проанализировал 7264 предполагаемых последовательности, и только 15 из них имеют достаточно экспериментальных данных для включения в официальный каталог, но в клетках всё ещё можно обнаружить тысячи белковых фрагментов с недостаточными экспериментальными данными. Эксперты Университета Хайдельберга в Германии называют это «крупным прорывом», который может открыть новые направления исследований.
Переименование поможет учёным понять роль пептидинов в клетке. Уже есть доказательства того, что более 50 пептидинов критически важны для клеток и могут быть связаны с детскими опухолями и функциями сердца. По мере накопления доказательств ожидается, что в официальные базы данных будет включено больше пептидинов, а некоторые типичные белки могут быть реклассифицированы. Соруководитель альянса ожидает новых открытий: «Люди больше не могут игнорировать их».
Официальное наименование и включение в базу данных
Тысячи «скрытых белков» в человеческом геноме получили официальное название «пептидины» и были включены в официальные базы данных, такие как GENCODE
Отбор на основе экспериментальных данных
Из 7264 предполагаемых кодирующих последовательностей только 15 имеют достаточно экспериментальных данных для включения в официальный каталог, но в клетках можно обнаружить тысячи белковых фрагментов с недостаточными экспериментальными данными
Потенциальная функциональная значимость
Более 50 пептидинов критически важны для клеток и могут быть тесно связаны с детскими опухолями головного мозга и функциями сердца
Динамическое обновление базы данных
Около 10 последовательностей, ранее считавшихся кодирующими «скрытые белки», уже включены в официальную базу данных, и ожидается, что в будущем будет добавлено больше пептидинов, а некоторые типичные белки могут быть переклассифицированы
Текст сгенерирован с использованием ИИ
