Scientific publication

00:00
Journal Article
Jun, 2024

Использование таргетного секвенирования для генотипирования овец породы джалгинский меринос

Криворучко А.Ю., Каниболоцкая А.А., Скорых Л.Н., Криворучко О.Н.

Abstract

Однонуклеотидные полиморфизмы (SNP), как наиболее важный тип генетической изменчивости, широко используются для подтверждения происхождения сельскохозяйственных животных и играют важную роль в селекции и разведении. Наиболее важным преимуществом при идентификации аллелей SNP является точность, что позволяет с уверенностью определять генотип. AgriSeq (ThermoFisher (США)) – это технология секвенирования, которая может быть использована для целенаправленной амплификации и повторного секвенирования тысяч мишеней SNP в рамках одной реакции. Этот метод специально адаптирован для животноводства и уже содержит готовые панели для некоторых видов домашних животных, однако, для использования их у овец необходимо провести предварительный отбор локусов, пригодных для генотипирования секвенированием. Цель работы: изучить эффективность выявления и распространенности локусов из предложенного набора SNP при обследовании новых поколений овец породы джалгинский меринос. Материалом для исследования послужили данные таргетного секвенирования геномов овец российских пород по сформированному набору локусов с целью выявления однонуклеотидных полиморфизмов. Предложенная панель локусов, модифицированная после валидации на втором поколении животных, содержит 352 замены, пригодных для генотипирования секвенированием и 413 полиморфизмов, ассоциированных с мясной продуктивностью животных. Оценка частоты встречаемости полиморфизмов, имеющих достоверную связь с показателями мясной продуктивности, между группами 2021 и 2022 года рождения показала, что большинство замен почти не различаются по частоте встречаемости между поколениями. Полученные в результате исследований показатели частоты встречаемости замен в группе выбранных животных позволяют сделать заключение, что выбранные нами полиморфизмы находятся в локусах, не подверженных существенным перестройкам в течение нескольких поколений, и могут быть информативны в течение достаточно длительного времени.

Full text: https://www.agronauka-sv.ru/jour/article/view/1674
The list is empty

Unfortunately this list is currently empty. Please try to refresh the page or come back later.

Sign Up
Information
Дата публикации: 26 Jun, 2024Кол-во просмотров: 308
Полный текст: www.agronauka-sv.ru
To quote:

Криворучко А.Ю., Каниболоцкая А.А., Скорых Л.Н., Криворучко О.Н. Использование таргетного секвенирования для генотипирования овец породы джалгинский меринос // Аграрная наука Евро-Северо-Востока. – 2024. – Т. 25. – № 3. – С. 453-464. https://doi.org/10.30766/2072-9081.2024.25.3.453-464

copied

Закрепленное