Новый метод позволяет измерить генную активность во всём организме мыши

Учёные недавно опубликовали исследование в журнале «Клетка», представив новый метод, позволяющий однократно измерить генную экспрессию всего организма мыши. Метод сочетает криостаты с молекулярными технологиями, позволяя проводить тонкослойное сечение замороженной мыши и анализировать активность тысяч генов в каждом срезе, что считается значительным технологическим прорывом в этой области.

Технология основана на принципах пространственной транскриптомики и использует зонды с молекулярными метками, размещённые на предметных стёклах, для захвата молекул РНК в гистологических срезах, тем самым определяя местоположение генной экспрессии. Команда из Университета Чикаго оптимизировала процесс обработки большого количества образцов и разработала вычислительные инструменты для анализа. В экспериментах использовались мыши в возрасте шести недель, при этом каждый срез охватывал около 600 000 точек измерения и 5 000 000 клеток.

Команда подтвердила потенциал метода, вводя мышам бактериальный токсин, и обнаружила, что токсин вызвал изменения в активности более 5 000 генов в 37 субрегионах тканей и 16 типах органов. Метод позволяет выявить системное воздействие лекарств на различные органы и способствует изучению заболеваний и генетических мутаций. Однако метод не достигает разрешения на уровне отдельных клеток и может упустить редкие транскрипты, но исследователи считают, что у него большие перспективы и он может привести к множеству биологических открытий.