В ходе исследования выявлены биоразнообразие и биогеографические характеристики многокомпонентного ракового микробиома

Исследовательский институт рака Дана-Фарбер в США, группа Мэттью Мейерсона, опубликовала исследование в журнале «Клетка», разработав новый процесс удаления и классификации хозяев для идентификации микробиомов в данных полногеномного секвенирования. В исследовании были проанализированы данные полногеномного секвенирования 16369 образцов опухолей с высокой глубиной секвенирования в рамках британского проекта по секвенированию геномов 100 тысяч человек, и было обнаружено, что микробиологические характеристики большинства типов рака не отличаются от фоновых.

Однако в опухолях органов ротовой полости и пищеварительной системы исследователи обнаружили мультидоменные микробные сообщества, включая бактерии, грибы, вирусы, археи и даже простейших паразитов — инфузорий. Эти сообщества различаются в зависимости от локализации опухоли и подтипа, особенно в опухолях с микросателлитной нестабильностью и мутациями в полимеразе ε (POLE) и полимеразе δ (POLD1), где наблюдается значительное увеличение колонизации микроорганизмами.

Исследование также выявило корреляцию между микробной нагрузкой и мутационной нагрузкой при раковых заболеваниях ротовой полости и пищеварительной системы. Это открытие указывает на то, что микробиом может играть важную роль в возникновении и развитии определённых типов рака, но для дальнейшего характеризования микробиома, связанного с опухолями, и разрешения противоречий, существующих в текущих исследованиях, требуются более продвинутые методы.