Test

Биологические свойства и генетическая структура клинических изолятов комплекса видов Klebsiella pneumoniae

Комплекс видов Klebsiella pneumoniae (Kp) представляет собой генетически и&nbsp;экологически разнообразную группу бактерий, вызывающую широкий спектр инфекций у&nbsp;людей и&nbsp;животных.Цель исследования. Биологическая характеристика и&nbsp;генотипирование на&nbsp;основе изучения разных локусов клинических изолятов Klebsiella pneumoniae.Материалы и&nbsp;методы. Объектом исследования стали три&nbsp;клинических изолята Kp, выделенные из&nbsp;разных биотопов пациентов детского многопрофильного стационара регионального уровня. В&nbsp;работе использован комплекс бактериологических, молекулярно-генетических и&nbsp;биоинформационных методов. Генотипирование изолятов проводили с&nbsp;использованием сервиса Института Пастера для&nbsp;штаммов видового комплекса K.&nbsp;pneumoniae.Результаты. Все штаммы были чувствительны к&nbsp;антимикробным препаратам групп карбапенемы (имипенем, меропенем) и&nbsp;тетрациклины (тигециклин) и&nbsp;демонстрировали высокую чувствительность к&nbsp;бактериофагу клебсиелл поливалентный. У&nbsp;изолятов Kp ODKB-16 и&nbsp;ODKB-81 отмечена антибиотикорезистентность к&nbsp;семи и&nbsp;восьми антимикробным препаратам соответственно.Согласно результатам мультилокусного типирования, все штаммы отнесены к&nbsp;филогруппе Kp1, имели K2-тип и&nbsp;различались по&nbsp;сиквенс-типам, профилю scgMLST629 и&nbsp;KL-типу. Штамм Kp ODKB-16 был определён как&nbsp;ST-65, scgST-11107, KL2; ODKB-07 – как&nbsp;ST-219, scgST-6401, KL125KL114; ODKB-81 – как&nbsp;ST-86, scgST-2800, KL2KL30. Кластеры генов вирулентности AbST, CbST, YbST, SmST и&nbsp;RmST были охарактеризованы только в&nbsp;геноме изолята Kp ODKB-16, что&nbsp;позволяет охарактеризовать его как&nbsp;высоковирулентный с&nbsp;множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ). Дополнительно у&nbsp;всех штаммов выявлены гены, ответственные за&nbsp;синтез фимбриальных адгезинов 1-го и&nbsp;3-го типов, а&nbsp;локусы ter-оперона – только у&nbsp;Kp ODKB-16. Анализ резистома показал, что&nbsp;все&nbsp;штаммы имели генотип&nbsp;2b. Плазмиды были определены в&nbsp;геномах Kp ODKB-81 (IncI2) и&nbsp;ODKB-16 (IncFIA&nbsp;+&nbsp;IncFIB&nbsp;+&nbsp;IncHI1B).Заключение. Использована комплексная схема для&nbsp;геномной таксономии клинических изолятов, которая может способствовать унификации глобальных и&nbsp;региональных особенностей возникновения и&nbsp;микроэволюции бактериальных патогенов.

Acta biomedica scientifica

Комплекс видов Klebsiella pneumoniae (Kp) представляет собой генетически и&nbsp;экологически разнообразную группу бактерий, вызывающую широкий спектр инфекций у&nbsp;людей ...