Генетическая гетерогенность популяции Rickettsia helvetica

Обоснование. Генетическая вариабельность Rickettsia helvetica недостаточно изучена.

Цель исследования. Изучить встречаемость и генетическую вариабельность R. helvetica в Ixodes spp., собранных в Сибири и на Дальнем Востоке.

Методы. На наличие риккетсий проанализированы клещи, снятые с грызунов в Омской области (n = 280) и собранные на флаг на островах Путятина и Русский в Приморском крае (n = 482). Для всех образцов риккетсий секвенированы фрагмента гена gltA, а для ряда образцов R. helvetica дополнительно секвенированы фрагменты 16S rRNA, ompA, ompB, sca4, htrA и groEL генов и 23S–5S межгенного спейсера.

Результаты. Всего было выявлено четыре вида риккетсий. Из них R. helvetica обнаружена в 72,2 % Ixodes apronophorus и 18,8 % Ixodes trianguliceps из Омской области и в единичных Ixodes persulcatus из Омской области и с острова Путятина. Это первое выявление риккетсий в I. apronophorus. На основании проведённого филогенетического анализа последовательности R. helvetica из данной работы и из базы данных GenBank отнесены к четырём генетическим линиям. Линия I включает европейские изоляты из Ixodes ricinus, изоляты из I. persulcatus из Западной Сибири и некоторые последовательности из I. apronophorus. Все последовательности R. helvetica из I. trianguliceps из Омской области и из I. persulcatus из Республики Коми, а также последовательность из I. apronophorus отнесены к линии II. Большинство последовательностей из I. apronophorus образуют линию III, а все последовательности R. helvetica из I. persulcatus с Дальнего Востока – линию IV.

Заключение. Впервые показана генетическая гетерогенность популяции R. helvetica. Известные изоляты R. helvetica надёжно отнесены к четырём генетическим линиям, однако ассоциация различных линий с определённым видом клеща или с определённой территорией наблюдается не во всех случаях.