Коронавирусы, циркулирующие среди грызунов и насекомоядных в Республике Алтай

Коронавирусы (семейство Coronaviridae, роды Alphacoronavirus и&nbsp;Betacoronavirus) относятся к числу опасных вирусных патогенов, вызвавших три вспышки тяжёлых респираторных заболеваний SARS, MERS, COVID-19. В России данные о коронавирусах, циркулирующих в природных резервуарах, ограничены, так как исследования начались только во время пандемии COVID-19.Цель работы. Исследование многообразия коронавирусов среди грызунов и насекомоядных в Республике Алтай.Материалы и методы. Грызуны (67&nbsp;особей) и насекомоядные (52&nbsp;особи) были отловлены в 2022 г. Образцы проанализированы методом обратной транскрипции – полимеразной цепной реакции и последующим секвенированием.Результаты и обсуждение. Положительными на коронавирусы оказались 4&nbsp;образца от&nbsp;грызунов (Myodes rutilus, M.&nbsp;glareolus, Apodemus peninsulae, A.&nbsp;agrarius) и&nbsp;2&nbsp;образца от&nbsp;насекомоядного (Crocidura sibirica), в которых обнаружены 3&nbsp;различных коронавируса. Ассоциированные с грызунами коронавирусы отнесены к роду Betacoronavirus, подроду Embecovirus и демонстрировали филогенетическое группирование в соответствии с видом природного носителя. Нуклеотидные последовательности сибирских изолятов коронавирусов от грызунов были идентичными для носителей близкородственных видов (M. rutilus и M. glareolus, A. agrarius и A. peninsulae) и близки (&gt; 94 % гомологии) к ранее опубликованным последовательностям в каждой из групп носителей, обнаруженных на территории Новосибирской области, Европы и Китая. К роду Betacoronavirus отнесён и&nbsp;коронавирус, выявленный от насекомоядного, возможно, относящийся к новому подроду семейства Coronaviridae.Заключение. Обнаружены 5&nbsp;видов природных носителей 3&nbsp;различных коронавирусов на территории Республики Алтай. Выявлен высокий уровень идентичности геномов коронавирусов от грызунов, свидетельствующий об относительно низкой скорости их эволюции.

Acta biomedica scientifica

коронавирус

таксономия

грызуны

насекомоядные

Сибирь

Коронавирусы (семейство Coronaviridae, роды Alphacoronavirus и&nbsp;Betacoronavirus) относятся к числу опасных вирусных патогенов, вызвавших три вспышки тяжёлых респираторн...

Коронавирусы, циркулирующие среди грызунов и насекомоядных в Республике Алтай

Авторы

Яшина Л.Н.

Абрамов С.А.

Сметанникова Н.А.

Малышев Б.С.

Кривопалов А.В.

Дупал Т.А.

Рекомендуем изучить