Особенности споруляции основных генетических линий Bacillus anthracis

Цель работы – характеристика генов и белков споруляции штаммов Bacillus anthracis основных генетических линий.Материалы и методы. Анализ геномов проводили in silico, используя геномы: B. anthracis Ames Ancestor в качестве референсного, 47 штаммов B. anthracis из базы данных GenBank NCBI, относящихся к основным генетическим линиям A, B, C, геном штамма CI Bacillus cereus biovar anthracis, 7 штаммов из коллекции ФКУЗ Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора, а также ресурс NCBI Protein Database. Идентификацию полиморфизмов осуществляли в программах BLASTn, BLASTp, MEGA X, MAUVE, Tandem Repeat Finder. Последовательности генов и белков выравнивали в программе MEGA X.Результаты и обсуждение. Сравнение полиморфизмов белков и генов споруляции трех основных генетических линий показало, что количество всех форм у штаммов B. anthracis линий B, C и B. cereus biovar anthracis превышало таковые у штаммов линии A в 4,5–10, 6,8–92 и 160–2078 раз соответственно. Бóльшее количество несинонимичных SNP в генах споруляции c изменением аминокислотного состава и функции белков у штаммов B. anthracis основных генетических линий B, С и B. cereus biovar anthracis, чем у штаммов линии A, предполагает их ограниченные адаптационные возможности и может быть одним из объяснений меньшей распространенности по сравнению с линией A.

Проблемы особо опасных инфекций

Bacillus anthracis

генетические линии

гены и белки прорастания спор

Цель работы – характеристика генов и белков споруляции штаммов Bacillus anthracis основных генетических линий.Материалы и методы. Анализ геномов проводили in silico, исполь...

Особенности споруляции основных генетических линий Bacillus anthracis

Авторы

Еременко Е.И.

Рязанова А.Г.

Печковский Г.А.

Писаренко С.В.

Ковалев Д.А.

Аксенова Л.Ю.

Семенова О.В.

Куличенко А.Н.

Рекомендуем изучить