Обнаружение и молекулярно-генетическая характеристика сегментированного флавиподобного вируса Янггоу в клещах Dermacentor nuttalli Ol. (1929) на территории Бурятии

Неблагополучная эпидемиологическая ситуация с трансмиссивными инфекциями, переносимыми клещами, может характеризоваться не  только ростом встречаемости уже  известных заболеваний, но  и  выявлением новых нозологических форм и возбудителей, роль которых пока остаётся малоизученной. Примером таких возбудителей является вирус Янггоу (YGTV, Yanggou tick virus), относящийся к группе сегментированных флавиподобных вирусов.

Цель исследования. Поиск и молекулярно-генетическая характеристика генетических вариантов YGTV, обнаруженных в клещах Dermacentor nuttalli Ol. (1929) на территории Республики Бурятия.

Материалы и методы. В исследовании проанализировано 350 индивидуальных образцов имаго клещей вида D. nuttalli, собранных в весенне-летний период 2023 г. на территории пяти районов Республики Бурятия. Выявление РНК YGTV выполняли с помощью метода полимеразной цепной реакции с  последующим определением нуклеотидной последовательности и  проведением филогенетического анализа для каждого из 4 сегментов генома.

Результаты. В  пробе клеща D.  nuttalli, отловленного на  территории Иволгинского района Республики Бурятия, была обнаружена РНК YGTV, что в дальнейшем было подтверждено секвенированием полученного фрагмента генома. Встречаемость РНК YGTV среди исследуемых клещей D. nuttalli в Бурятии составила 0,3 % (95%-й доверительный интервал: 0,1–1,6). Были разработаны праймеры, позволяющие получить фрагменты всех четырёх сегментов генома YGTV. Выявленный генетический вариант YGTV при проведении филогенетического анализа по всем четырём сегментам отчётливо группируется с последовательностями YGTV, обнаруженными ранее в Китае и России (Республика Горный Алтай и Тыва). Наибольшую степень идентичности выявленный вариант показывает с прототипом Erzin14-T20074.

Заключение. В исследовании впервые показано наличие YGTV на территории Республики Бурятия, что актуализирует необходимость мониторинга циркуляции этого вируса в природных очагах инфекций, переносимых клещами на этой территории, а также дальнейшего уточнения границ распространения флавиподобных вирусов, потенциально опасных для человека.