Влияние азоксимера бромида при добавлении в среду культивирования Yersinia pestis EV НИИ ЭГ на отдельные геномные и протеомные характеристики штамма

Цель исследования – изучение влияния иммуноадъюванта азоксимера бромида (полиоксидоний, ПО) при добавлении его в среду культивирования на отдельные молекулярно-генетические и протеомные особенности штамма Yersinia pestis EV НИИЭГ. Материалы и методы. Y. pestis EV НИИЭГ выращивали при 28 °С в течение 48 ч на агаре LB, рН 7,2 (Miller), как с ПО (EV+ПО), так и без (EV). Полногеномное секвенирование штаммов EV и EV+ПО проводили на платформе II поколения Ion S5 XG. Полногеномный SNP-анализ и поиск маркерных SNPs осуществляли в программе Wombac 2.0. Снятие масс-спектров экстрактов клеток Y. pestis EV и EV+ПО проводили на масс-спектрометре Microflex LT. Протективные свойства тестируемых культур оценивали по интегральному показателю ImD50 на мышах BALB/c при заражении Y. pestis 231(708). Результаты и обсуждение.При сравнительном анализе в структуре генома штаммов Y. pestis EV+ПО делеций, инсерций и единичных нуклеотидных замен, приводящих к нарушению продукции факторов патогенности, иммуногенности и обеспечения жизнедеятельности возбудителя чумы, не обнаружено. Методом MALDI-TOF масс-спектрометрии установлено, что у штаммов Y. pestis EV+ПО изменяется интенсивность 22 % от общего количества пиков в диапазоне 2000–20000 Да. Основная часть измененных пиков относится по банку белков UniProtKB к не охарактеризованным протеинам и метаболическим белкам. При этом у культур, выращенных с добавлением ПО, ImD50 в 2–3,3 раза ниже, чем у Y. pestis EV. Таким образом, добавление ПО в среду культивирования Y. pestis EV НИИЭГ не вызывает изменений в генах факторов патогенности и обеспечения жизнедеятельности возбудителя чумы, но модулирует ее белковый профиль, что сопровождается повышением протективного потенциала вакцинного штамма.

Проблемы особо опасных инфекций

чума

чумная вакцина

Y. pestis EV НИИЭГ

азоксимера бромид

секвенирование

масс-спектрометрия

Цель исследования – изучение влияния иммуноадъюванта азоксимера бромида (полиоксидоний, ПО) при добавлении его в среду культивирования на отдельные молекулярно-генетические...

Влияние азоксимера бромида при добавлении в среду культивирования Yersinia pestis EV НИИ ЭГ на отдельные геномные и протеомные характеристики штамма

Авторы

Гончарова А.Ю.

Бугоркова С.А.

Абдрашитова А.С.

Щербакова Н.Е.

Краснов Я.М.

Германчук В.Г.

Девдариани З.Л.

Швиденко И.Г.

Щуковская Т.Н.

Рекомендуем изучить