Выявление новых особенностей структуры генома нетоксигенных штаммов Vibrio cholerae O1 биовара Эль Тор ctxAB – tcpA +

Цель исследования – сравнительный анализ структуры и распространенности генов патогенности, лекарственной устойчивости и персистенции среди природных нетоксигенных штаммов Vibrio cholerae биовара Эль Тор с генотипом ctxAB^– tcpA⁺.
Материалы и методы. Проанализированы полные геномы 73 токсигенных и 33 нетоксигенных штаммов холерных вибрионов с помощью методов мультилокусного сиквенс-типирования в онлайн-сервисе MLST2.0 на платформе CGE (Center Genomic Epidemiology) и филогенетического анализа с применением программы MrBayes v.3.2.7a.
Результаты и обсуждение. Выявлены новые геномные особенности природных нетоксигенных штаммов V. cholerae Эль Тор с генотипом ctxAB⁻tcpA⁺, относящихся к филогенетической линии L3. Установлено, что по ST-типу, наличию мобильных элементов ICE и VSP-II, аллельному профилю генов патогенности (tcpA, rtxA) и лекарственной устойчивости (gyrA и parC), а также присутствию гена VC2346 ряд штаммов из этой группы имели значительное генетическое сходство с токсигенными и были, видимо, производными типичных или генетически измененных штаммов возбудителя холеры. Филогенетический анализ подтвердил явную генетическую близость этих изолятов с токсигенными и показал их принадлежность к филогенетической линии эпидемически опасных штаммов, а именно к L2. Таким образом, среди природных нетоксигенных холерных вибрионов Эль Тор ctxAB⁻ tcpA⁺ обнаружены штаммы с генетическими маркерами возбудителя холеры, что указывает на их происхождение от этих штаммов и свидетельствует о необходимости разработки диагностических средств для дифференциации нетоксигенных штаммов с разным патогенным потенциалом.