Бактериальная микробиота желудочно-кишечного тракта овец романовской породы

Цель исследований – метабаркодинг микробиоценоза желудочно-кишечного тракта молодняка овец романовской породы, выращенных с применением пробиотика «Яросил» и без него. Исследования проведены в ООО «Юрьевское» Первомайского района Ярославской области на ягнятах романовской породы. Материалом для исследований служили образцы слизистой оболочки рубца, слепой кишки и кал ягнят контрольной и опытной групп. Проанализирована доля различных операционных таксономических единиц (ОТЕ) смешанных проб разных отделов желудочно-кишечного тракта молодняка овец. Методом высокопроизводительного секвенирования V3–V4 региона гена 16S рРНК показано доминирование представителей филумов Bacillota, Pseudomonadota, Verrucomicrobiota и Actinomycetota. Микробиота рубца ягнят контрольной группы характеризовалась значительным преобладанием бактерий рода Latilactobacillus – почти 75 %. Такая высокая концентрация бактерий может свидетельствовать об их важной роли в процессах ферментации и усвоения питательных веществ в рубце. В отличие от рубца, в кишечном микробиоме доминировали бактерии родов Nanosyncoccus и Faecousia, указывая на специализацию микробных сообществ в разных отделах пищеварительной системы. Рассчитаны индексы биологического разнообразия: индекс Шеннона варьирует от 2,55 до 5,76 в контрольной группе, от 4,65 до 6,13 – в опытной, индекс Бергера-Паркера – от 0,11 до 0,55 и от 0,09 до 0,23 соответственно.