Видовое разнообразие нетуберкулёзных микобактерий, выделенных от пациентов в Иркутской области (ретроспективное исследование)

Обоснование. Иркутская область остаётся регионом с высоким бременем туберкулёза с множественной лекарственной устойчивостью и напряжённой ситуацией по ВИЧ-инфекции. Для иммунокомпрометированных лиц опасность представляет распространение нетуберкулёзных микобактерий (НТМБ), вызывающих микобактериоз лёгких – состояние, имитирующее туберкулёз, однако требующее дифференциальной диагностики и иных подходов к лечению. Региональные исследования распространения НТМБ остаются ограниченными. Низкая разрешающая способность стандартных микробиологических методик требует поиска молекулярных мишеней для видовой идентификации НТМБ.

Цель. Оценка видового разнообразия НТМБ, выделенных от пациентов с подозрением на туберкулёз и микобактериоз лёгких, в Иркутской области.

Методы. Проведён ретроспективный анализ штаммов НТМБ, полученных от 63 пациентов, проходивших лечение в ОГБУЗ «Иркутская областная клиническая туберкулёзная больница» в период с 2018 по 2024 гг. Видовая идентификация НТМБ выполнена для 50 изолятов секвенированием фрагментов гена 23S рРНК и groEL2 с последующим филогенетическим анализом.

Результаты. Среди изученных штаммов доминируют представители Mycobacterium avium complex (MAC, 65,9 %), включая M. avium (53,7 %) и M. intracellulare (12,2 %). Совместный анализ фрагмента гена 23S рРНК и groEL2 обеспечил разделение видов внутри MAC-комплекса, идентификацию широкого спектра медленнои быстрорастущих НТМБ (M. paragordonae, M. abscessus, М. fortuitum, M. holsaticum и M. farcinogenes, M. senegalense), а также немикобактериальных патогенов (Nocardia farcinica, Streptococcus oralis, Staphylococcus epidermidis, Actinomadura sp.).

Заключение. В динамике охарактеризован таксономический спектр выделенных НТМБ в Иркутской области. Секвенирование генов 23S рРНК и groEL2 позволяет преодолеть проблему идентификации НТМБ.