Современные особенности изоляции и идентификации патогенных лептоспир в Сибири и на Дальнем Востоке

В последнее время изоляция культур патогенных лептоспир в Российской Федерации – крайне редкое явление.

Цель работы – обобщить опыт Иркутского противочумного института по выделению и идентификации культур лептоспир с 2011 г.

Материалы и методы. Методом ПЦР и в реакции микроскопической агглютинации (РМА) исследован материал от восьми лиц с подозрением на лептоспироз и от 942 мелких млекопитающих (ММ), бактериологическим методом – от людей и 260 ММ. Для идентификации культур использовали бактериологический температурный тест, РМА, ПЦР, мультилокусное сиквенс-типирование (MLST) и MALDI-TOF масс-спектрометрию (MS) с оригинальной базой белковых профилей лептоспир. В ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора получены полные геномы шести штаммов.

Результаты и обсуждение. У людей на фоне приема антибиотиков не удалось изолировать лептоспиры, несмотря на положительные результаты ПЦР и РМА. От ММ выделено четыре культуры Leptospira borgpetersenii серогруппы Javanica и три L. kirschneri (Grippotyphosa). Результаты идентификации методами MLST по схеме № 1 и MALDI-TOF MS идентичны. MLST in silico показало однотипность двух штаммов серогруппы Grippotyphosa из Приморья и Хабаровска с профилем сиквенс-типов (ST) 110:100:94. У четырех штаммов серогруппы Javanica по схеме № 1 определяется ST 146, а по схемам № 2–3 выявлены уникальные одиночные нуклеотидные полиморфизмы. Таким образом, в 2012–2016 гг. в Сибири и на Дальнем Востоке изолировано семь культур патогенных лептоспир от носителей в природных очагах при их инфицированности от 12,0 до 48,9 %. Штаммы серогруппы Javanica отличаются особенностями MLST-профиля и более длительно приспосабливаются к питательным средам, чем штаммы серогруппы Grippotyphosa.