Выявление фагоиндуцируемых мобильных генетических элементов в штаммах Vibrio cholerae О1 биовара Эль Тор

Приобретение новых мобильных генетических элементов способствует генетическому разнообразию штаммов Vibrio cholerae. Важная роль в данном процессе принадлежит генетическому материалу, получаемому от фагов.

Цель работы – выявление фагоиндуцируемых PLE-островов в штаммах V. cholerae О1-серогруппы и определение устойчивости изолятов, содержащих и не имеющих данные мобильные генетические элементы, к литическому действию бактериофага холерного диагностического эльтор.

Материалы и методы. Использовали нуклеотидные последовательности полных геномов токсигенных и нетоксигенных штаммов V. cholerae О1, представленных в NCBI GenBank. Биоинформационный анализ проводили с применением алгоритма BLAST, MEGA X (или BioEdit v. 7.0.9.0). Тест с фагами ставили по методу А. Грациа.

Результаты и обсуждение. При анализе 39 токсигенных штаммов, завезенных на территорию РФ и сопредельных стран, выявлен штамм V. cholerae О1 классического биовара, содержащий остров PLE5, и 13 штаммов V. cholerae О1 биовара Эль Тор, включающих остров PLE4. В нетоксигенных штаммах PLE-острова не обнаружены. Показано, что штаммы с PLE4 относятся к геновариантам V. cholerae О1 биовара Эль Тор и имеют аллель гена ctxB1. Изоляты с данным мобильным элементом вызвали единичные случаи (1994–1999 гг.), а также вспышки холеры на территории РФ (1993–1994 гг., 1998 г. – Дагестан; 1993 г. – Татарстан) и Украины (1994–1995 гг.). Высказано предположение, что, возможно, присутствие острова PLE4 вносит определенный вклад в обеспечение устойчивости штаммов V. cholerae О1 биовара Эль Тор к холерному диагностическому фагу эльтор (выявлено 55,6 % фагоустойчивых изолятов), но существуют и другие, пока не выявленные, механизмы. Таким образом, получены данные о присутствии новых мобильных генетических элементов в геноме ранее завезенных токсигенных штаммов V. cholerae О1 биовара Эль Тор, что расширяет сведения об их генетической организации.