Пространственная MLVA25-генотипическая структура Yersinia pestis ssp. pestis в трансграничном Сайлюгемском природном очаге чумы
Аннотация
Для осуществления эпидемиологического надзора за чумой в Сайлюгемском природном очаге совместно с монгольскими специалистами внедрены и применяются современные молекулярно-генетические методы диагностики и типирования Yersinia pestis ssp. pestis в полевом и клиническом материале. Цель работы – изучить пространственную генотипическую структуру Y. pestis ssp. pestis в трансграничном Сайлюгемском природном очаге чумы методом MLVA25‑типирования. Материалы и методы. Проведено MLVA25‑типирование 160 штаммов Y. pestis ssp. pestis, изолированных в Сайлюгемском природном очаге чумы в 2012–2021 гг. Построение филогенетического древа осуществляли методами UPGMA и MST. Результаты и обсуждение. На основе кластерного анализа 25 VNTR-локусов штаммы Y. pestis ssp. pestis, изолированные в трансграничном Сайлюгемском природном очаге чумы, дифференцированы на 15 MLVA‑типов. Установлено, что исследуемые штаммы образуют однородный комплекс MLVA25‑типов без выраженной географической структурированности их по семи пространственным группам. При анализе частоты встречаемости числа тандемных повторов по трем вариабельным локусам у штаммов Y. pestis ssp. pestis выявлено, что между выборками из монгольской и российской частей очага наблюдаются значимые различия. Наиболее выраженные различия пространственной генотипической структуры прослеживаются по локусу yp4280ms62.
