Конструирование набора реагентов «ГенПест-подвид/алтай-РГФ»

Цель – разработка набора реагентов, позволяющего проводить детекцию ДНК возбудителя чумы в пробах клинического и биологического материала, объектов окружающей среды с одновременным определением его принадлежности к основному и неосновным подвидам, дифференциацией отдельно алтайского биовара центральноазиатского подвида. Материалы и методы. На специфические генетические маркеры подобраны комплекты праймеров с помощью программы VectorNTI 10, определены оптимальные условия проведения полимеразной цепной реакции для приборов типа RotorGene. Для оценки специфичности и чувствительности разработанного набора реагентов использовано 44 штамма микроорганизмов, из которых 19 Yersinia pestis и 25 штаммов гетерологичных микроорганизмов. Диагностическая чувствительность «ГенПест-подвид/алтай-РГ Ф» – не менее 98,6 % при доверительной вероятности 91 %. Диагностическая специфичность «ГенПест-подвид/алтай-РГ Ф» – не менее 99 % при доверительной вероятности 91 %. Результаты и обсуждение. Разработано медицинское изделие «Набор реагентов для выявления и дифференциации штаммов возбудителя чумы основного и неосновных подвидов (отдельно алтайского биовара центральноазиатского подвида) методом полимеразной цепной реакции с гибридизационно-флуоресцентным учетом результатов в режиме реального времени (ГенПест-подвид/алтай-РГ Ф)». Набор реагентов прошел государственную регистрацию в установленном порядке. Применение разработанного набора реагентов является актуальным для Горно-Алтайского высокогорного очага чумы РФ и сопредельной части Монголии.