Научная публикация

00:00
Голос Науки
Голос Науки
...
Статья в журнале
Окт, 2020

Филогенетическая история Каракумского пустынного очага

Ерошенко Г.А., Куклева Л.М., Альхова Ж.В., Балыкова А.Н., Попов Н.В., Краснов Я.М., Червякова Н.С., Кутырев В.В.

PDF
DOI: 10.21055/0370-1069-2020-3-56-61

Аннотация

Цель исследования – анализ филогенетического родства штаммов и направлений распространения Yersinia pestis в Каракумском пустынном очаге в XX в.

Материалы и методы. Выполнено полногеномное секвенирование 8 штаммов Yersinia pestis, выделенных в Каракумском пустынном очаге в 1949–1985 гг. При проведении филогенетического анализа также использованы нуклеотидные последовательности 16 штаммов Y. pestis из сопредельных очагов Восточного и Северного Прикаспия 1917–2002 гг., секвенированные в РосНИПЧИ «Микроб» на платформе Genestudio Ion S5XL (Thermo Fischer Scientific). Филогенетический анализ выполнен на основе 1720 выявленных коровых SNPs. Построение филогенетического дерева проводили в программе PhyML 3.1 с помощью алгоритма Maximum Likelihood модели нуклеотидных замен GTR.

Результаты и обсуждение. По данным полногеномного SNP анализа штаммов Y. pestis из Каракумского пустынного очага, очагов Восточного и Северного Прикаспия проведен филогенетический анализ популяций возбудителя чумы, циркулировавших в Туркменистане в XX в. Показано, что по территории Каракумского пустынного очага прошли три независимые волны распространения Y. pestis. Происхождение первой, зарегистрированной в 1912 г., вспышки чумы в юго-восточной части очага и ее этиологический агент остаются пока неустановленными. Вторая волна связана с распространением на этих территориях в 1949–1970 гг. северо-приаральской популяции 2.MED1 средневекового биовара, приведшим к проявлению здесь эпизоотической активности в 1949 г., а также к последующим случаям и вспышкам чумы в середине XХ в. В середине второй половины прошлого века Каракумского пустынного очага достигла еще одна волна распространения 2.MED1 из Северного Прибалхашья. Эта центрально-азиатская популяция также укоренилась в природном биоценозе Каракумского очага. Полученные данные свидетельствуют об активных процессах распространения Y. pestis средневекового биовара в Восточном Прикаспии в южной подзоне пустынь Евразии в XX в. 

Полный текст: https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1364
ИнфоАвторыИнтервью автораОбсуждения

Авторы

Ерошенко Г.А.

Описание недоступно

Автор еще не стал участником

Куклева Л.М.

Описание недоступно

Автор еще не стал участником

Альхова Ж.В.

Описание недоступно

Автор еще не стал участником

Балыкова А.Н.

Описание недоступно

Автор еще не стал участником

Попов Н.В.

Описание недоступно

Автор еще не стал участником

Краснов Я.М.

Описание недоступно

Автор еще не стал участником

Червякова Н.С.

Описание недоступно

Автор еще не стал участником

Кутырев В.В.

Описание недоступно

Автор еще не стал участником

Показаны все результаты
Логотип "Голос Науки"
Спонсор
* не является рекламой
Регистрация
Проблемы особо опасных инфекций
Научный журнал
Для цитирования:

Ерошенко Г.А., Куклева Л.М., Альхова Ж.В., Балыкова А.Н., Попов Н.В., Краснов Я.М., Червякова Н.С., Кутырев В.В. Филогенетическая история Каракумского пустынного очага // Проблемы особо опасных инфекций. – 2020. – № 3. – С. 56-61. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2020-3-56-61

скопировано