Фено- и генотипические особенности нетоксигенных штаммов холерных вибрионов различного происхождения, изолированных на территории России
Аннотация
Цель. Анализ фенотипической характеристики и выявление особенностей генотипической организации нетоксигенных штаммов холерных вибрионов, имеющих различное происхождение и изолированных на территории России.
Материалы и методы. Использована выборка из 548 нетоксигенных штаммов, полученная с помощью авторской пополняемой ГИС «Холера 1989–2014». ПЦР -генотипирование проводили в соответствии со «Способом идентификации нетоксигенных штаммов холерных вибрионов О1 серогруппы с помощью ПЦР для выделения генетических детерминант». Кластерный анализ проводили с использованием метода UPGMA. Построение дендрограммы осуществляли с помощью программы MEGA 5.
Результаты и обсуждение. Показана типичность штаммов V. cholerae по культурально-морфологическим, серологическим и биохимическим свойствам. Выявлена изменчивость изучаемых штаммов по признаку фаголизабельности. Определены уникальные фаготипы, ранее не встречавшиеся на территории России. Популяция нетоксигенных штаммов холерных вибрионов О139 серогруппы была генетически однородной в отличие от изолятов V. cholerae O1 El Tor и имела идентичные ПЦР -генотипы. Показана универсальность метода ПЦР -генотипирования по 14 генам-мишеням, позволяющего дифференцировать изученные штаммы V. cholerae О1 и O139, а также выявлять различия среди штаммов О139, выделенных в различных географических регионах страны.
Цитирование
Левченко Д.А., Кругликов В.Д., Гаевская Н.Е., Водопьянов А.С., Непомнящая Н.Б. Фено- и генотипические особенности нетоксигенных штаммов холерных вибрионов различного происхождения, изолированных на территории России // Проблемы особо опасных инфекций. – 2020. – № 3. – С. 89-96. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2020-3-89-96