Полиморфизм тРНК Leu и тРНК Ser митохондриальной ДНК свиней различных пород

Анализ последовательности митохондриальной ДНК (мтДНК), имеющей материнский характер наследования, служит эффективным способом оценки индивидуальных особенностей коммерческих линий. В работе проведен анализ вариабельности последовательностей генов тРНКSer и тРНКLeu мтДНК у свиней различных пород. В качестве объектов исследования были выбраны гены мтДНК тРНКLeuІ, тРНКLeu2, tRNASerI, tRNASer2. Для изучения последовательностей из базы National Center for Biotechnological Information (NCBI) были выбраны данные по свиньям различных пород. Выравнивание нуклеотидных последовательностей проводили с использованием программы BioEdit. Анализ последовательностей показал наличие полиморфизмов во всех изучаемых генах. Всего установлено шесть полиморфных сайтов, которые представлены транзициями. Анализ гена тРНКLeuІ показал наличие замены A/G в позиции 3892 ии у свиней китайской селекции породы Wuzhishan и свиней японской селекции Luchuan, а также замены С/T в позиции 3907 п.н. у шведского дикого кабана. По гену тРНКLeu2у большинства исследуемых пород отмечено одновременное присутствие двух транзиций в позиции 12879 п.н., что обуславливает замену А/G и в позиции 12883 п.н. и соответствует замене С/Т. В результате исследований по гену тРНКSer1 установлено наличие одной транзиции А/G в позиции 8103 п.н. у свиней крупной белой породы корейской селекции. Полиморфизм гена тРНКSer2 представлен трансзицией Т/С в позиции 12838 п.н. у итальянского дикого кабана. Наибольшее количество полиморфизмов встречалось у свиней крупной белой породы корейской и китайской селекции, а также у представителей итальянского дикого кабана. Изучение полиморфизма мтДНК племенных свиней позволит установить возможные ассоциативные связи и разработать мтДНК-маркеры, которые могут быть использованы в программах по совершенствованию и созданию племенных ресурсов в свиноводстве.