Биологические свойства и генетическая структура клинических изолятов комплекса видов Klebsiella pneumoniae

Комплекс видов Klebsiella pneumoniae (Kp) представляет собой генетически и&nbsp;экологически разнообразную группу бактерий, вызывающую широкий спектр инфекций у&nbsp;людей и&nbsp;животных.Цель исследования. Биологическая характеристика и&nbsp;генотипирование на&nbsp;основе изучения разных локусов клинических изолятов Klebsiella pneumoniae.Материалы и&nbsp;методы. Объектом исследования стали три&nbsp;клинических изолята Kp, выделенные из&nbsp;разных биотопов пациентов детского многопрофильного стационара регионального уровня. В&nbsp;работе использован комплекс бактериологических, молекулярно-генетических и&nbsp;биоинформационных методов. Генотипирование изолятов проводили с&nbsp;использованием сервиса Института Пастера для&nbsp;штаммов видового комплекса K.&nbsp;pneumoniae.Результаты. Все штаммы были чувствительны к&nbsp;антимикробным препаратам групп карбапенемы (имипенем, меропенем) и&nbsp;тетрациклины (тигециклин) и&nbsp;демонстрировали высокую чувствительность к&nbsp;бактериофагу клебсиелл поливалентный. У&nbsp;изолятов Kp ODKB-16 и&nbsp;ODKB-81 отмечена антибиотикорезистентность к&nbsp;семи и&nbsp;восьми антимикробным препаратам соответственно.Согласно результатам мультилокусного типирования, все штаммы отнесены к&nbsp;филогруппе Kp1, имели K2-тип и&nbsp;различались по&nbsp;сиквенс-типам, профилю scgMLST629 и&nbsp;KL-типу. Штамм Kp ODKB-16 был определён как&nbsp;ST-65, scgST-11107, KL2; ODKB-07 – как&nbsp;ST-219, scgST-6401, KL125KL114; ODKB-81 – как&nbsp;ST-86, scgST-2800, KL2KL30. Кластеры генов вирулентности AbST, CbST, YbST, SmST и&nbsp;RmST были охарактеризованы только в&nbsp;геноме изолята Kp ODKB-16, что&nbsp;позволяет охарактеризовать его как&nbsp;высоковирулентный с&nbsp;множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ). Дополнительно у&nbsp;всех штаммов выявлены гены, ответственные за&nbsp;синтез фимбриальных адгезинов 1-го и&nbsp;3-го типов, а&nbsp;локусы ter-оперона – только у&nbsp;Kp ODKB-16. Анализ резистома показал, что&nbsp;все&nbsp;штаммы имели генотип&nbsp;2b. Плазмиды были определены в&nbsp;геномах Kp ODKB-81 (IncI2) и&nbsp;ODKB-16 (IncFIA&nbsp;+&nbsp;IncFIB&nbsp;+&nbsp;IncHI1B).Заключение. Использована комплексная схема для&nbsp;геномной таксономии клинических изолятов, которая может способствовать унификации глобальных и&nbsp;региональных особенностей возникновения и&nbsp;микроэволюции бактериальных патогенов.

Acta biomedica scientifica

комплекс видов Klebsiella pneumoniae

генотипирование

мультилокусный анализ

множественная антибиотикорезистентность

антимикробные препараты

вирулентность

Комплекс видов Klebsiella pneumoniae (Kp) представляет собой генетически и&nbsp;экологически разнообразную группу бактерий, вызывающую широкий спектр инфекций у&nbsp;людей ...

Биологические свойства и генетическая структура клинических изолятов комплекса видов Klebsiella pneumoniae

Authors

Белькова Н.Л.

Клименко Е.С.

Немченко У.М.

Григорова Е.В.

Ситникова К.О.

Зугеева Р.Е.

Смурова Н.Е.

Чемезова Н.Н.

Савилов Е.Д.

We recommend that you study