Генетическая гетерогенность популяции Rickettsia helvetica

Обоснование. Генетическая вариабельность Rickettsia helvetica недостаточно изучена.Цель исследования. Изучить встречаемость и генетическую вариабельность R. helvetica в Ixodes spp., собранных в Сибири и на Дальнем Востоке.Методы. На наличие риккетсий проанализированы клещи, снятые с грызунов в Омской области (n = 280) и собранные на флаг на островах Путятина и Русский в Приморском крае (n = 482). Для всех образцов риккетсий секвенированы фрагмента гена gltA, а для ряда образцов R. helvetica дополнительно секвенированы фрагменты&nbsp;16S rRNA, ompA, ompB, sca4, htrA и groEL генов и 23S–5S межгенного спейсера.Результаты. Всего было выявлено четыре вида риккетсий. Из них R. helvetica обнаружена в 72,2 % Ixodes apronophorus и 18,8 % Ixodes trianguliceps из Омской области и в единичных Ixodes persulcatus из Омской области и с острова Путятина. Это первое выявление риккетсий в I. apronophorus. На основании проведённого филогенетического анализа последовательности R. helvetica из данной работы и из базы данных GenBank отнесены к четырём генетическим линиям. Линия&nbsp;I включает европейские изоляты из Ixodes ricinus, изоляты из I. persulcatus из Западной Сибири и некоторые последовательности из I. apronophorus. Все последовательности R. helvetica из I. trianguliceps из Омской области и из I. persulcatus из Республики Коми, а также последовательность из I. apronophorus отнесены к линии II. Большинство последовательностей из I. apronophorus образуют линию III, а все последовательности R. helvetica из I. persulcatus с Дальнего Востока – линию IV.Заключение. Впервые показана генетическая гетерогенность популяции R.&nbsp;helvetica. Известные изоляты R.&nbsp;helvetica надёжно отнесены к четырём генетическим линиям, однако ассоциация различных линий с определённым видом клеща или с определённой территорией наблюдается не во всех случаях.

Acta biomedica scientifica

Ixodes apronophorus

Ixodes persulcatus

Ixodes trianguliceps

Rickettsia helvetica

область симпатрии

генетические линии

филогенетический анализ

Обоснование. Генетическая вариабельность Rickettsia helvetica недостаточно изучена.Цель исследования. Изучить встречаемость и генетическую вариабельность R. helvetica в Ixo...

Генетическая гетерогенность популяции Rickettsia helvetica

Authors

Рар В.А.

Иголкина Я.П.

Якименко В.В.

Тикунов А.Ю.

Никитин А.Я.

Епихина Т.И.

Тикунова Н.В.

We recommend that you study