Test

Коронавирусы, циркулирующие среди грызунов и насекомоядных в Республике Алтай

Коронавирусы (семейство Coronaviridae, роды Alphacoronavirus и&nbsp;Betacoronavirus) относятся к числу опасных вирусных патогенов, вызвавших три вспышки тяжёлых респираторных заболеваний SARS, MERS, COVID-19. В России данные о коронавирусах, циркулирующих в природных резервуарах, ограничены, так как исследования начались только во время пандемии COVID-19.Цель работы. Исследование многообразия коронавирусов среди грызунов и насекомоядных в Республике Алтай.Материалы и методы. Грызуны (67&nbsp;особей) и насекомоядные (52&nbsp;особи) были отловлены в 2022 г. Образцы проанализированы методом обратной транскрипции – полимеразной цепной реакции и последующим секвенированием.Результаты и обсуждение. Положительными на коронавирусы оказались 4&nbsp;образца от&nbsp;грызунов (Myodes rutilus, M.&nbsp;glareolus, Apodemus peninsulae, A.&nbsp;agrarius) и&nbsp;2&nbsp;образца от&nbsp;насекомоядного (Crocidura sibirica), в которых обнаружены 3&nbsp;различных коронавируса. Ассоциированные с грызунами коронавирусы отнесены к роду Betacoronavirus, подроду Embecovirus и демонстрировали филогенетическое группирование в соответствии с видом природного носителя. Нуклеотидные последовательности сибирских изолятов коронавирусов от грызунов были идентичными для носителей близкородственных видов (M. rutilus и M. glareolus, A. agrarius и A. peninsulae) и близки (&gt; 94 % гомологии) к ранее опубликованным последовательностям в каждой из групп носителей, обнаруженных на территории Новосибирской области, Европы и Китая. К роду Betacoronavirus отнесён и&nbsp;коронавирус, выявленный от насекомоядного, возможно, относящийся к новому подроду семейства Coronaviridae.Заключение. Обнаружены 5&nbsp;видов природных носителей 3&nbsp;различных коронавирусов на территории Республики Алтай. Выявлен высокий уровень идентичности геномов коронавирусов от грызунов, свидетельствующий об относительно низкой скорости их эволюции.

Acta biomedica scientifica

Коронавирусы (семейство Coronaviridae, роды Alphacoronavirus и&nbsp;Betacoronavirus) относятся к числу опасных вирусных патогенов, вызвавших три вспышки тяжёлых респираторн...