Scientific publication

00:00
Голос Науки
Голос Науки
...
Journal Article
Sep, 2024

Влияние азоксимера бромида при добавлении в среду культивирования Yersinia pestis EV НИИ ЭГ на отдельные геномные и протеомные характеристики штамма

Гончарова А.Ю., Бугоркова С.А., Абдрашитова А.С., Щербакова Н.Е., Краснов Я.М., Германчук В.Г., Девдариани З.Л., Швиденко И.Г., Щуковская Т.Н.

DOI: 10.21055/0370-1069-2024-3-81-87

Abstract

Цель исследования – изучение влияния иммуноадъюванта азоксимера бромида (полиоксидоний, ПО) при добавлении его в среду культивирования на отдельные молекулярно-генетические и протеомные особенности штамма Yersinia pestis EV НИИЭГ. Материалы и методы. Y. pestis EV НИИЭГ выращивали при 28 °С в течение 48 ч на агаре LB, рН 7,2 (Miller), как с ПО (EV+ПО), так и без (EV). Полногеномное секвенирование штаммов EV и EV+ПО проводили на платформе II поколения Ion S5 XG. Полногеномный SNP-анализ и поиск маркерных SNPs осуществляли в программе Wombac 2.0. Снятие масс-спектров экстрактов клеток Y. pestis EV и EV+ПО проводили на масс-спектрометре Microflex LT. Протективные свойства тестируемых культур оценивали по интегральному показателю ImD50 на мышах BALB/c при заражении Y. pestis 231(708). Результаты и обсуждение.

При сравнительном анализе в структуре генома штаммов Y. pestis EV+ПО делеций, инсерций и единичных нуклеотидных замен, приводящих к нарушению продукции факторов патогенности, иммуногенности и обеспечения жизнедеятельности возбудителя чумы, не обнаружено. Методом MALDI-TOF масс-спектрометрии установлено, что у штаммов Y. pestis EV+ПО изменяется интенсивность 22 % от общего количества пиков в диапазоне 2000–20000 Да. Основная часть измененных пиков относится по банку белков UniProtKB к не охарактеризованным протеинам и метаболическим белкам. При этом у культур, выращенных с добавлением ПО, ImD50 в 2–3,3 раза ниже, чем у Y. pestis EV. Таким образом, добавление ПО в среду культивирования Y. pestis EV НИИЭГ не вызывает изменений в генах факторов патогенности и обеспечения жизнедеятельности возбудителя чумы, но модулирует ее белковый профиль, что сопровождается повышением протективного потенциала вакцинного штамма.

Full text: https://journal.microbe.ru/jour/article/view/2044
InfoAuthorsDiscussions

No discussions yet

Be the first to ask a question or suggest a topic for discussion about this research work.

Start a discussion
Golos Nauki Logo


Support Project
Sponsor
* is not an advertisement
Main menu

Categories

    Sign Up
    Information
    Date of publication: 30 Sep, 2024Number of views: 55
    Full text: journal.microbe.ru
    To quote:

    Гончарова А.Ю., Бугоркова С.А., Абдрашитова А.С., Щербакова Н.Е., Краснов Я.М., Германчук В.Г., Девдариани З.Л., Швиденко И.Г., Щуковская Т.Н. Влияние азоксимера бромида при добавлении в среду культивирования Yersinia pestis EV НИИ ЭГ на отдельные геномные и протеомные характеристики штамма // Проблемы особо опасных инфекций. – 2024. – № 3. – С. 81-87. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2024-3-81-87

    copied
    Проблемы особо опасных инфекций
    Scientific Journal

    Pinned