Изучение устойчивости нетоксигенных штаммов Vibrio cholerae О1 биовара Эль Тор, с разной структурой антифаговых систем, к литическому действию холерного диагностического бактериофага эльтор

Цель работы – изучить присутствие антифаговых систем в геноме нетоксигенных штаммов Vibrio cholerae О1 биовара Эль Тор и определить устойчивость штаммов с разной структурой данных систем к холерному диагностическому бактериофагу эльтор. Материалы и методы. В работе использовали 126 нетоксигенных (ctxА– tcpА+ и ctxА– tcpА– ) штаммов V. cholerae О1 Эль Тор, выделенных на территории Российской Федерации и сопредельных стран из внешней среды и от больных острыми кишечными инфекциями с 1972 по 2018 г. Секвенирование проводили на платформе MGI DNBSEQ-G50. Для биоинформационного анализа использовали программы fastp v0.23, unicycler v0.4.7, Blast 2.16.0 и MEGA X. Взаимодействие холерного диагностического бактериофага эльтор с поверхностью бактерий исследовали методом атомно-силовой микроскопии. Результаты и обсуждение. В геноме изученных штаммов не выявлены фагоиндуцируемые острова PLE и BREX-системы. В то же время 75 % ctxА– tcpА+ штаммов содержат гены рестрикции-модификации I типа, у ctxА– tcpА– штаммов данные гены не обнаружены. Гены CBASS-системы присутствуют у единичных штаммов обеих групп. Установлено наличие системы CRISPR-Cas I типа в геноме 36 (33 %) ctxА– tcpА– штаммов, выделенных в разных регионах нашей страны. При этом 78 % штаммов, содержащих данную систему, резистентны к холерному диагностическому бактериофагу эльтор. Таким образом, установлена гетерогенность изученных нетоксигенных штаммов V. cholerae О1 Эль Тор по наличию антифаговых систем, что расширяет сведения об их генетической организации. Нетоксигенные ctxAB– tcpA– штаммы V. cholerae О1 Эль Тор более устойчивы к литическому действию холерного диагностического бактериофага эльтор, чем ctxAB– tcpA+. Одной из причин их резистентности может быть присутствие системы CRISPR-Cas I типа.

Проблемы особо опасных инфекций

Vibrio cholerae

нетоксигенные штаммы

гены антифаговых систем

система CRISPR-Cas I типа

устойчивость к бактериофагу эльтор

Цель работы – изучить присутствие антифаговых систем в геноме нетоксигенных штаммов Vibrio cholerae О1 биовара Эль Тор и определить устойчивость штаммов с разной структурой...

Authors

Сергутин Д.А.

Плеханов Н.А.

Челдышова Н.Б.

Осин А.В.

Щелканова Е.Ю.

Федоров А.В.

Краснов Я.М.

Заднова С.П.

We recommend that you study