Scientific publication

00:00
Голос Науки
Голос Науки
...
Journal Article
Sep, 2025

Интегральная оценка эпидемиологической опасности генетических линий Mycobacterium tuberculosis в системе геномного эпидемиологического надзора

Синьков В.В., Огарков О.Б., Жданова С.Н., Савилов Е.Д.

DOI: 10.29413/ABS.2025-10.4.24

Abstract

Введение. Распространение лекарственно-устойчивого туберкулёза требует внедрения новых аналитических подходов для оценки эпидемиологических рисков на основе данных полногеномного секвенирования (whole-genome sequencing; WGS).

Цель. Разработать интегральный индекс эпидемиологической опасности (ИИЭО); учитывающий территориальные особенности распространения; а также биологические и генетические характеристики возбудителя; влияющие на формирование лекарственной устойчивости штаммов Mycobacterium tuberculosis (МБТ).

Материалы и методы. В исследование включены 5538 геномов МБТ; охватывающих широкий спектр генотипов с территорий стран постсоветского пространства. Для каждого штамма рассчитывались мутационная нагрузка по генам устойчивости и частота распространения генотипа в популяции. Были применены методы логарифмической трансформации; нормализации и агрегирования показателей в единый интегральный индекс эпидемиологической опасности (ИИЭО). Прогностическая значимость индекса оценивалась с помощью ROC кривой.

Результаты. В настоящем исследовании представлен интегральный индекс эпидемиологической опасности (ИИЭО); одновременно учитывающий распространённость генотипов МБТ в человеческой популяции и уровень мутационной нагрузки в генах; ассоциированных с устойчивостью к противотуберкулёзным препаратам.

Применение ROC подтвердило высокую прогностическую значимость ИИЭО (AUC = 0;867); а также устойчивость метода при анализе неоднородных популяционных данных.

Заключение. Полученные результаты демонстрируют практическую применимость ИИЭО для ранней идентификации штаммов с высоким риском распространения в рамках геномного эпидемиологического надзора.

Full text: https://www.actabiomedica.ru/jour/article/view/5571
InfoAuthorsDiscussions

Authors

Синьков В.В.

Description is not available

The author has not yet become a participant

Огарков О.Б.

Description is not available

The author has not yet become a participant

Жданова С.Н.

Description is not available

The author has not yet become a participant

Савилов Е.Д.

Description is not available

The author has not yet become a participant

All results are shown
Golos Nauki Logo
Home page
Быстрый доступ
Support Project
Sponsor
* is not an advertisement
Categories
    Sign Up
    Information
    Date of publication: 23 Sep, 2025Number of views: 28
    Full text: www.actabiomedica.ru
    To quote:
    Синьков В.В., Огарков О.Б., Жданова С.Н., Савилов Е.Д. Интегральная оценка эпидемиологической опасности генетических линий Mycobacterium tuberculosis в системе геномного эпидемиологического надзора // Acta Biomedica Scientifica. – 2025. – Т. 10. – № 4. – С. 244-254. https://doi.org/10.29413/ABS.2025-10.4.24
    copied
    Acta biomedica scientifica
    Scientific Journal