Методология интегральной оценки эпидемиологического риска территорий в контексте эволюционной динамики доминирующих генотипов Mycobacterium tuberculosis

<div>Обоснование. Существующие методы микробиологического мониторинга туберкулеза ограничены ретроспективным анализом и не учитывают динамику генетической структуры популяции патогена. Отсутствие инструментов, интегрирующих молекулярно-генетические показатели в количественные модели, препятствует переходу к предиктивному риск-ориентированному надзору.Цель исследования. Разработать и обосновать методологию применения интегрального показателя эпидемиологического риска территории в системе геномного эпидемиологического надзора за туберкулезом с множественной и широкой лекарственной устойчивостью в регионах Российской Федерации для изучения динамики эпидемического процесса и прогнозирования его неблагоприятных тенденций.Материалы и методы. Архитектура индекса базируется на консолидации региональной статистики и комплекса генотипических детерминант: коэффициентов априорной опасности генетических линий, частоты их распространения и уровня лекарственной устойчивости. Для определения статистических порогов эпидемической значимости генотипов использовано имитационное моделирование методом Монте-Карло (100 000 итераций). Шкалирование уровней риска проведено на основе квартильного анализа те-оретического распределения (10 000 итераций). Апробация инструмента выполнена на данных четырех субъектов Российской Федерации.Результаты. В ходе моделирования определен критический порог коэффициента экспансии (2,15; p &lt; 0,001), позволяющий математически обоснованно идентифицировать эпидемически значимые генотипы. Квартильный анализ обеспечил объективную классификацию территорий по уровню угрозы дестабилизации ситуации. Высокое значение коэффициента детерминации (R^2 = 0,874) подтверждает, что структура популяции возбудителя является определяющим фактором регионального эпидемиологического неблагополучия.Заключение. Разработанный индекс отвечает вызовам современной эпидемиологии, позволяя выявлять скрытую экспансию агрессивных генотипов до их отражения в стандартной отчетности. Инструмент применим как в рамках мониторинга методом полимеразной цепной реакции, так и в системах полногеномного секвенирования, что делает его универсальной платформой для государственного санитарно-эпидемиологического контроля.</div>

Acta biomedica scientifica

Mycobacterium tuberculosis

эпидемиологический надзор

генотип

множественная лекарственная устойчивость

математическое моделирование

факторы риска

прогнозирование

Обоснование. Существующие методы микробиологического мониторинга туберкулеза ограничены ретроспективным анализом и не учитывают динамику генетической структуры популяции па...

Методология интегральной оценки эпидемиологического риска территорий в контексте эволюционной динамики доминирующих генотипов Mycobacterium tuberculosis

Authors

Синьков В.В.

Жданова С.Н.

Савилов Е.Д.

Огарков О.Б.

We recommend that you study