Эволюция и географическое распространение Brucella melitensis генетической линии II на территории Российской Федерации

<div>Цель работы – филогеографический и эволюционный анализ штаммов Brucella melitensis генетической линии II, выделенных на территории Российской Федерации, в контексте изучения глобальной популяции вида.Материалы и методы. В исследовании использовали 282 штамма B. melitensis из коллекции патогенных микроорганизмов ФКУЗ Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора. Полногеномное секвенирование осуществляли с помощью секвенатора DNBSEQ G50RS (MGI, Китай) с использованием набора реагентов MGIEasy FAST FS DNA Library Prep Set V2.1 (MGI, Китай) по стандартному протоколу. Эволюционный и филогеографический анализ проводили на базе программного пакета BEAST v2.7.5.Результаты и обсуждение. Установлено, что штаммы B. melitensis в Российской Федерации принадлежат к четырем субгенотипам генетической линии II, дивергировавшей предположительно в XVI в.: IIb, IIg, IIh и IIi. Единичные случаи выявления в России изолятов субгенотипов IIb и IIg указывают на завоз инфекции из стран Ближнего Востока. Субгенотип IIh распространен в Сибири, Монголии, Китае и Казахстане. Варианты наиболее представительного и генетически гетерогенного субгенотипа IIi циркулируют на обширной территории от Северного Кавказа до Северного Китая и, как правило, выделяются в ходе эпидемиологических расследований вспышек бруцеллеза в европейской части страны. Полученные результаты указывают на перспективу использования полногеномного SNP-анализа как эффективного инструмента для своевременного выявления неэндемичных или атипичных вариантов возбудителя бруцеллеза в ходе геномного профилирования отдельных регионов.</div>

Проблемы особо опасных инфекций

Brucella melitensis

полногеномное секвенирование

байесовский анализ

филогения

эволюция

Цель работы – филогеографический и эволюционный анализ штаммов Brucella melitensis генетической линии II, выделенных на территории Российской Федерации, в контексте изучени...

Эволюция и географическое распространение Brucella melitensis генетической линии II на территории Российской Федерации

Authors

Ковалев Д.А.

Писаренко С.В.

Шапаков Н.А.

Кузнецова И.В.

Жиров А.М.

Пономаренко Д.Г.

Куличенко А.Н.

We recommend that you study