Test

Выявление генетического материала вирусов Tacheng uukuvirus и Sara tick phlebovirus в таежных клещах Свердловской, Томской областей и Приморского края России и их филогения

Широкое распространение заболеваний, передающихся клещами, представляет значительную проблему для общественного здравоохранения и здоровья населения, проживающего в эндемичных районах.Цель&nbsp;работы – с использованием метода высокопроизводительного секвенирования провести поиск, анализ генетического материала и идентификацию новых вирусных агентов семейства&nbsp;Phenuiviridae&nbsp;в иксодовых клещах, собранных в различных регионах азиатской части России.Материалы и методы.&nbsp;В исследовании использованы 1460 таежных клещей, собранных в пригородных районах Томска, Екатеринбурга и в Приморском крае. Генетический материал, выделенный из клещей, анализировали методом высокопроизводительного секвенирования с использованием технологии Illumina с последующим филогенетическим анализом.Результаты и обсуждение.&nbsp;Анализ результатов секвенирования позволил обнаружить протяженные нуклеотидные последовательности L-гена, характерного для вирусов семейства&nbsp;Phenuiviridae.&nbsp;Удалось идентифицировать 20 нуклеотидных последовательностей длиной в среднем 250 п.н. в гомогенатах клещей&nbsp;Ixodes persulcatus.&nbsp;Восемнадцать изолятов идентифицированы как представители рода&nbsp;Uukuvirus&nbsp;и два изолята отнесены к роду&nbsp;Phlebovirus&nbsp;семейства&nbsp;Phenuiviridae.&nbsp;Филогенетический анализ показал, что все изоляты рода&nbsp;Uukuvirus&nbsp;кластеризуются с Tacheng tick virus 2, который относится к виду Tacheng uukuvirus. Они формируют отдельную филогенетическую группу этого вида вируса, близкую к двум румынским вариантам 2019 г. Генетический материал Tacheng tick virus 2 обнаружен во всех трех исследованных регионах азиатской части России. Два томских изолята флебовируса классифицированы как Sara tick phlebovirus.&nbsp;При этом они кластеризовались с двумя изолятами флебовирусов из Карелии.&nbsp;Таким образом, в клещах&nbsp;I. persulcatus, собранных в трех географически различных регионах азиатской части России, обнаружен генетический материал Tacheng tick virus 2 и Sara tick phlebovirus, относящийся к двум родам семейства&nbsp;Phenuiviridae.

Проблемы особо опасных инфекций

Широкое распространение заболеваний, передающихся клещами, представляет значительную проблему для общественного здравоохранения и здоровья населения, проживающего в эндемич...

Выявление генетического материала вирусов Tacheng uukuvirus и Sara tick phlebovirus в таежных клещах Свердловской, Томской областей и Приморского края России и их филогения

Authors