Исторические и современные классификации возбудителя чумы

В обзоре представлены данные по отечественным и зарубежным фенотипическим классификациям штаммов Yersinia pestis, разработанным в XX в.; генетическим классификациям XXI в.; а также по генеалогии древних штаммов чумного микроба, реконструированной с помощью палеогеномных технологий. С момента открытия возбудителя чумы в 1894 г. были созданы многие классификации, которые соответствовали уровню развития микробиологии на тот период времени. В основу внутривидовых классификационных схем XX в. положены три принципа: фенотипические различия между штаммами, особенности видового состава носителей и географическая принадлежность. С развитием молекулярной микробиологии в начале XXI в. разработана генетическая номенклатура ветвей эволюции возбудителя и создан ряд классификаций, построенных на анализе популяционной структуры Y. pestis. Через призму генетического разнообразия штаммов Y. pestis из природных очагов чумы России, стран ближнего и дальнего зарубежья разработана усовершенствованная классификация с выделением семи подвидов: pestis, tibetica, caucasica, qinghaica, angolica, central asiatica, ulegeica, – которая разделила подвиды по филогенетическому принципу и по эпидемической значимости. С развитием палеомикробиологии в генеалогию Y. pestis включены доисторические линии эволюции, которые расширили сведения по внутривидовому разнообразию чумного микроба.