Анализ геномного разнообразия SARS-CoV-2 и эпидемиологических признаков адаптации возбудителя COVID-19 к человеческой популяции (Сообщение 1)

Цель – изучение эволюции генома вируса SARS-CoV-2 при адаптации к организму человека в период текущей пандемии.Материалы и методы. Использовалась база данных (GISAID) по нуклеотидным последовательностям геномов вируса SARS-CoV-2, полученных из образцов клинического материала в период с конца декабря&nbsp;2019 по июль 2020 г. Построение филогенетических деревьев проводили с помощью программного обеспечения&nbsp;BioNumerics 7.6 с использованием алгоритма максимальной экономии (maximum parsimony).Результаты и обсуждение. Самым существенным устойчивым изменением в геномах вируса SARS-CoV-2 являются связанные&nbsp;единичные мутации в гене ORF1b (P314L) и гене S (D614G), в результате чего к настоящему времени подавляющее большинство выявляемых изолятов этого вируса имеет данную пару замен. Замена в гене S (D614G) многими исследователями ассоциируется со снижением патогенности содержащих ее штаммов, что, однако, может&nbsp;быть объяснено и улучшением методологии лечения больных в ходе пандемии. Влияние мутации в гене ORF1b&nbsp;(P314L) еще не изучено. Мутации P314L и D614G тесно связаны, и только их совместное присутствие в геноме&nbsp;дало преимущество для распространения данным геновариантам вируса SARS-CoV-2. Анализ обобщенных эпидемиологических данных свидетельствует о том, что распространение новых геновариантов вируса может быть&nbsp;связано с их биологическими свойствами, облегчающими передачу от человека к человеку, при этом ассоциированное снижение летальности может отражать не только прогресс в методах лечения, но и вероятное ослабление вирулентных свойств. Наблюдаемое увеличение потенциала распространения на фоне признаков снижения&nbsp;вирулентности, вероятно, является основной формой адаптации нового коронавируса к человеческой популяции&nbsp;и, повидимому, будет продолжаться в дальнейшем в виде интеграции SARS-CoV-2 в структуру сезонных возбудителей ОРВИ.&nbsp;

Проблемы особо опасных инфекций

COVID-19

SARS-CoV-2

пандемия

передача от человека человеку

вирулентность

эволюция возбудителя

Цель – изучение эволюции генома вируса SARS-CoV-2 при адаптации к организму человека в период текущей пандемии.Материалы и методы. Использовалась база данных (GISAID) по ну...

Анализ геномного разнообразия SARS-CoV-2 и эпидемиологических признаков адаптации возбудителя COVID-19 к человеческой популяции (Сообщение 1)

Authors

Краснов Я.М.

Попова А.Ю.

Сафронов В.А.

Федоров А.В.

Баданин Д.В.

Щербакова С.А.

Кутырев В.В.

We recommend that you study