Факторы вирулентности и филогенетическая характеристика уропатогенных штаммов Eschericihia coli , выделенных на территории г. Саратова
Abstract
Цель. Молекулярно-генетическая характеристика штаммов уропатогенных Escherichia coli, выделенных из мочи пациентов с инфекциями мочевыводящих путей на территории Саратова, с целью определения принадлежности к филогенетическим группам и подгруппам и выявления генетических маркеров, ассоциированных с вирулентностью. Материалы и методы. Исследовано 102 штамма уропатогенных E. coli, выделенных из мочи пациентов с инфекциями мочевыводящих путей. методом пцр определяли частоту встречаемости генов (fimH, pap, sfa, afa, iha, irp2, iuc, iroN, hlyA, vat, usp, set-1, kpsMT, iss, cva, ompT), ассоциированных с факторами адгезии, утилизации железа, токсигенности, устойчивости к действию сыворотки (комплемента) и персистенции, а также принадлежность к конкретным филогенетическим группам и подгруппам (путем амплификации генов chuA, yjaA и TspE4.C2). Результаты и обсуждение. Установлено, что исследованные штаммы E. coli принадлежали к различным филогенетическим группам и подгруппам (A1, B1, B23, D1 и D2) и различались набором генов, кодирующих основные факторы вирулентности. при этом частота выявления уропатогенных E. coli, относящихся к подгруппе B23, оказалась превалирующей. Более того, штаммы данной филогенетической подгруппы отличались наибольшим набором генов, кодирующих факторы вирулентности возбудителя. у всех изученных штаммов уропатогенных E. coli, принадлежащих к различным филогенетическим группам и подгруппам, выявлено наличие генов, ответственных за синтез сидерофоров (irp2, iuc, iroN), устойчивости и персистенции (ompT) и факторов адгезии (fimH, iha). Таким образом, штаммы уропатогенных E. coli, выделенные от пациентов с инфекциями мочевыводящих путей в Саратове, принадлежат к различным филогенетическим группам и подгруппам и обладают различным набором генетических маркеров вирулентности, что может оказывать влияние на степень патогенности возбудителя и отражаться на тяжести течения и длительности заболевания.